까미 계산기 다운로드

유전자 또는 유전자 의 그룹에 대한 CAI를 계산하는 프로그램 및 서버의 수는 코돈W, EMBOSS [15], CAIJava [3], CAI 분석기 [8]뿐만 아니라 JCAT [16] 및 CAI 계산기 [5]와 같은 다른 곳에서 사용할 수 있습니다. 이러한 모든 도구는 귀중한 리소스를 나타냅니다. 그러나 현재 형태의 도구는 기존 도구에 비해 상대적으로 사소한 진보로 보이며, 출판 전에 소프트웨어와 원고의 광범위한 점검을 고려할 것을 저자에게 강력히 권장합니다. 그러나, 나는 현재의 작품은 필드와 문학에 유용한 기여의 씨앗을 포함 생각하고, 확실히 소프트웨어와 논문의 대상 관객에 대해 더 신중하게 생각, 인내 저자를 격려한다. 저자의 응답 : 귀하의 의견과 세 명의 추가 심판의 의견을 받은 후, 우리는 코드를 다시 작성하고 원고를 수정하고 게시하기로 결정했습니다. 우리는 귀하의 의견에 다시 한번 감사드립니다. 우리는 원고와 독립 실행형 버전의 소스 코드에서 일부 변경이 필요하고 그에 따라 수행된 것으로 동의하기 때문에 소프트웨어의 추가 점검이 필요하지 않다고 생각합니다. 제안 한 의견을 소개 한 후 코드를 읽기가 더 쉽다는 것을 인정하게되어 기쁩니다. 원고의 추가 변경은 또한 NIH 펠로우 편집위원회의 권고에 따라 영어의 품질의 두 번째 개정, 몇 가지 설명을 포함한다. 우리는 진심으로 당신이 원고의 이전 버전에 제기 비판을 해결한 것을 고려합니다. 비 학자에 의해 사용 하는 모든 제한: 라이센스 필요 O`Brien EA, 장 Y, 양 L, 왕 E, 마리 V, 랭 BF, 버거 G: GOBASE – 세포 및 세균 게놈 정보의 데이터베이스. 핵산 Res 2006, 34: D697-699.

10.1093/nar/gkj098 이 문서에서는 웹 기반 서버 http://genomes.urv.es/CAIcal 구현된 입력 및 참조 데이터에서 코돈 적응 지수(CAI)의 자동 계산 및 관련 측정을 위한 일련의 도구에 대해 설명합니다. CAI 값은 게놈 분석 및 유전자 발현 분석에서 잠재적인 수평 유전자 전달 이벤트의 검출에 이르는 다양한 목적으로 유용하다. 저자가 지적했듯이 CAI 계산을 제공하는 많은 자유롭게 사용할 수있는 시설이 이미 존재하지만이 새로운 도구 세트는 몇 가지 추가 견적을 얻을 수있는 가능성을 제공합니다. 여기에는 관찰된 CAI와 비교할 수 있는 입력 서열의 GC 함량 및 아미노산 조성을 갖는 임의로 생성된 서열에서 예상되는 CAI의 계산뿐만 아니라 각 코돈의 중량 및 그래픽 표현의 측정이 포함됩니다. 주석을 테스트하고 검증하기 위해 이러한 CAI 측정의 가능한 유용성의 예가 제공됩니다. 나는 온라인으로 액세스 할 수있는 도구의이 그룹이 과학 커뮤니티에 도움이 될 것입니다 찾을 수 있습니다. 이 웹 기반 서버가 다양한 사용자의 점진적인 입력과 제안으로 이점을 얻고 개선되기를 바랍니다. BMC 생물 정보학 볼륨 9, 기사 번호: 65 (2008) 이 기사를 인용 더 많은 관심은 소프트웨어의 독립적 인 조각으로 게시 될 경우이 작품의 특정 기여에 지불 할 필요가있다.

Posted on February 8, 2020 in Uncategorized

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